Il Direttore generale, organo responsabile dell'azione amministrativa dell'ente,  presiede l'organizzazione interna del personale e dei servizi, assicurandone l'unità operativa e di indirizzo. Può assistere alle sedute del Consiglio di indirizzo e vigilanza.

È nominato con decreto del Presidente del Consiglio dei Ministri o con decreto ministeriale su proposta del Presidente dell'Inps. Dura in carica 5 anni.

 Le funzioni del Direttore generale sono dettagliatamente descritte dall'art. 8 del Regolamento di organizzazione dell'Istituto approvato con deliberazione del Consiglio di Amministrazione n. 4 del 6 maggio 2020